Учёные впервые извлекли ДНК древних медведей из фрагментов кала
Секвенированы ДНК из отложений в пещере на севере Мексики: ученые получили ядерные геномы двух видов североамериканских медведей.
Исследования пещеры Чикиуите (Chiquihuite) ведутся с 2012 года. Там были обнаружены каменные орудия труда возрастом от 25 000 до 30 000 лет. В нынешнем исследовании молекулярный палеоэколог Миккель Винтер Педерсен (Mikkel Winther Pedersen) и его коллеги хотели определить, какие еще виды животных бывали в этой пещере. Для этого они взяли 48 образцов с разных уровней отложений на дне пещеры и попытались извлечь ДНК. При этом они не остановились на выделении только митохондриальной ДНК, как делалось в предыдущих работах по выделению древней ДНК из почвы, а секвенировали всю ДНК в каждом образце. Для этого ученые воспользовались методами, позволяющими расшифровать миллиарды нуклеотидных оснований всего за несколько дней, и разработали компьютерное программное обеспечение для обработки и анализа всех этих данных.
«Когда животное или человек мочится или испражняется, клетки организма также выводятся из организма. И фрагменты ДНК этих клеток — это то, что мы можем обнаружить в образцах почвы. Используя чрезвычайно мощные методы секвенирования, мы впервые реконструировали геномы — генетические профили — на основе об этих фрагментов», — объясняет палеогенетик Эске Виллерслев из Копенгагенского университета.
Исследователи секвенировали геномы двух видов медведей, посещавших пещеру. Прочитанные фрагменты они сопоставили с ДНК медведей, уже имеющимися в общедоступных базах данных. По митохондриальной ДНК исследователи смогли определить, что предки медведей барибалов (Ursus americanus) жили в районе пещеры долгое время — в течение по крайней мере 3000 лет. Другой геном соответствовал ныне исчезнувшему виду — гигантскому короткомордому медведю (Arctodus simus), который вымер около 11 000 лет назад и наиболее известен по окаменелостям, найденным в Канаде.
Результаты позволили выяснить судьбу медведей Северной Америки во время последнего оледенения и сразу после него. Сравнив геномы древних барибалов с геномами их сородичей со всей Северной Америки, команда Педерсена выяснила, что по мере исчезновения льда в Северной Америке некоторые барибалы переместились на север, распространившись вплоть до Аляски. Другие спаривались с барибалами с более далекого запада, а их потомки впоследствии заселили юго-запад США.
Авторы подчеркивают, что их работа не только дает представление о судьбе американских медведей, но и служит доказательством действенности метода. Она демонстрирует, как можно анализировать древнюю ДНК из образцов окружающей среды аналогично тому, как это делается сейчас с ДНК из ископаемых останков животных.
Ещё по теме: Загадочная болезнь превращает чёрных медведей в дружелюбных собак
Про животных — в соцсетях: •
Про животных — в соцсетях: •
Экосистема озера Байкал выступает уникальной ресурсной базой для перспективных исследований и разработок, которые ведут ученые Иркутского государственного университета. Одним из таких передовых исследований является проект молодого ученого НИИ биологии ИГУ, кандидата биологических наук Полины Дроздовой. Об этом сообщает пресс-служба вуза.
Научный руководитель Гидрометцентра Роман Вильфанд озвучил прогноз на конец апреля, назвав регионы, в которые приходит чуть ли не лето. Увы, Иркутск в их число не входит…
Лимнологический институт СО РАН в 2020 году провёл реконструкцию климата последних 22 тысяч лет на основе изучения вещественного состава и структуры донных отложений малых озер Восточной Сибири, расположенных на протяжении от 51 до 58 градуса северной широты. Об этом сообщает пресс-служба ИНЦ СО РАН.
Сотрудники НИИ биологии ИГУ совместно с коллегами из Технологического института Джорджии (США) опубликовали в международном журнале расширенных научных обзоров статью «Антропогенное влияние и состояние экосистемы озера Байкал». Об этом на своей странице в соцсети «Фейсбук» сообщил глава иркутского НИИ биологии Максим Тимофеев.
Подведомственное учреждение Россельхознадзора, «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ФГБУ ВНИИЗЖ), выпустило первую партию вакцины для профилактики коронавируса у животных. Об этом заявила советник руководителя Россельхознадзора Юлия Мелано.